A meta-analysis to evaluate the cellular processes regulated by the interactome

A expressão de receptores de estrogénio (RE) é a ferramenta de diagnóstico e terapêutica usada nas decisões relativas ao tratamento do cancro da mama. A natureza das proteínas e complexos proteicos que regulam a localização subcelular e atividade do RE ainda constituem uma questão aberta na biologia do cancro da mama. A identificação de tais complexos irá ajudar a compreender o desenvolvimento de resistência endócrina no cancro da mama RE+. Nos últimos anos, a espectrometria de massa tem permitido uma análise abrangente do interactoma do RE. O objetivo deste estudo foi comparar trabalhos publicados que tivessem analisado o interactoma do RE, a fim de identificar uma «impressão digital» relacionada com os processos biológicos regulados pelo RE. Concluímos que estes processos vão além da transcrição, o que poderá ter influência no desenvolvimento da resistência a terapia endócrina nos tumores que mantêm a expressão do RE. A metodologia de isolamento dos complexos, e o facto do RE ser expresso naturalmente ou sobre-expresso nas células contribui para as diferenças observadas entre os distintos trabalhos. No entanto, todas as abordagens analisadas nesta meta-análise são válidas e complementares; em particular nos casos em que os processos ocorrem em baixa frequência com níveis normais de RE e podem ser identificados quando o receptor é sobre-expresso.

Autores e Afiliações:
Joana Simões¹, Francisco M. Amado¹,², Rui Vitorino¹,³,* and Luisa A. Helguero¹,³,*

¹ Mass Spectrometry Centre, QOPNA Research Unit, Department of Chemistry, Universidade de Aveiro, Campus Universitário de Santiago, Aveiro, Portugal

² School of Healh Sciences, Universidade de Aveiro, Portugal

³ Institute for Research in Biomedicine - iBiMED, Health Sciences Program, Universidade de Aveiro, Portugal * These authors are Senior authors

Abstract:
The nature of the proteins complexes that regulate ERα subcellular localization and activity is still an open question in breast cancer biology. Identification of such complexes will help understand development of endocrine resistance in ER+ breast cancer. Mass spectrometry (MS) has allowed comprehensive analysis of the ERα interactome. We have compared six published works analyzing the ERα interactome of MCF-7 and HeLa cells in order to identify a shared or different pathway-related fingerprint. Overall, 806 ERα interacting proteins were identified. The cellular processes were differentially represented according to the ERα purification methodology, indicating that the methodologies used are complementary. While in MCF-7 cells, the interactome of endogenous and over-expressed ERα essentially represents the same biological processes and cellular components, the proteins identified were not over-lapping; thus, suggesting that the biological response may differ as the regulatory/participating proteins in these complexes are different. Interestingly, biological processes uniquely associated to ERα over-expressed in HeLa cell line included L-serine biosynthetic process, cellular amino acid biosynthetic process and cell redox homeostasis. In summary, all the approaches analyzed in this meta-analysis are valid and complementary; in particular, for those cases where the processes occur at low frequency with normal ERα levels, and can be identified when the receptor is over-expressed. However special effort should be put into validating these findings in cells expressing physiological ERα levels.

Revista: Oncoscience

Link: http://www.impactjournals.com/oncoscience/index.php?abs=138